《恶魔的谜语》故事舞台设定在一个名为“10年黑组”的全住宿制女子高中的班级,这个几只小猪似的老鼠在吱吱地啃着商场里的食物,就在陈源惊讶这些老鼠之大的时候,这些原本并没有因为陈源的到来而闪躲的老鼠突然竖起全身灰毛,然后纷纷像没头苍蝇一样四处逃窜,片刻之间就消失得无影无踪。班级里的12名学生都是由暗杀者构成的,她们全都瞄准了她们的同学——一之濑晴的姓命。即使她的姓命被众多人觊觎,一之濑晴依然发誓一定要活着毕业。另一方面,同样也是准备夺取一之濑晴姓命的暗杀者——转校生东兔角却在一次次接近对方时,渐渐地被晴所吸引。在同学们对晴展开攻击之时,兔角则以保护者的姿态与她们开始了战斗。